Au début de l’affaire, en mars 2014, 26 personnes ont été inculpées, dont Mücella Yapıcı de Taksim Solidarity, pour avoir « fondé et dirigé une organisation » destinée à soutenir des activités terroristes. Ces personnes ont été acquittées le 29 avril 2015 par la 33e Cour pénale de première instance d’Istanbul. C’est dans cette affaire, également qualifiée de première phase du procès Gezi, que Can Atalay a défendu ses clients en tant qu’avocat.

Le 19 février 2019, soit quatre ans après le procès, Can Atalay et 16 autres personnes, dont Osman Kavala, ont été inculpés pour avoir prétendument organisé et financé les manifestations de Gezi. Initialement dirigées contre les plans d’urbanisme du parc central de Gezi à Istanbul, les manifestations ont évolué en 2013 en un mouvement de protestation plus large, qui a été violemment réprimé. L’accusation était portée par 746 plaignants, au premier rang desquels se trouvaient le président Recep Tayyip Erdoğan et ses ministres. Une peine de prison s’étendant de 606 à 2 000 ans était requise pour les 16 accusés, y compris l’avocat Can Atalay. Can Atalay et d’autres accusés ont été condamnés pour avoir tenté de renverser le gouvernement de la République de Turquie et de l’empêcher d’exercer ses fonctions. De nombreux chefs d’accusation graves avaient été dressés contre eux, tels que pillage, coups et blessures et résistance à la loi sur la protection de la culture et de la nature. Aucun élément de preuve concret n’a été produit durant le procès, hormis des appels téléphoniques et des tweets échangés entre les accusés, dénués de force probante. Bien qu’il ait été clairement établi qu’ils n’avaient pas soutenu les incitations à la violence dans ces discussions, le tribunal a jugé qu’il existait des soupçons suffisants. L’inculpation a été déclarée recevable et l’affaire renvoyée devant la 30e Haute Cour pénale d’Istanbul.